史序凡例卷一风暑湿燥温热卷二咽喉耳目口齿咳嗽咳血喘胸痹虚劳不寐心悸健忘卷三肝风呕吐噎格脘痛腹痛泄泻痢疟卷四肿胀遗精遗尿淋浊疝气疮疡调经带下胎前产后
叙言卷一脏腑经络先后病脉证第一痉湿病脉证第二卷二百合狐惑阴阳毒病证治第三疟病脉证并治第四中风历节病脉证并治第五卷三血痹虚劳病脉证并治第六肺痿肺痈咳嗽上气病脉证治第七卷四奔气病证治第八胸痹心痛短气病脉证
进表卷一治诸风（附香港脚）至宝丹灵宝丹润体丸乌犀丸牛黄清心丸摩挲丸透冰丹龙脑天麻煎牛黄小乌犀丸娄金丸龙虎丹麝香天麻丸龙脑芎犀丸银液丹和太师牛黄丸碧霞丹雄朱丸八风丹牛黄生犀丸辰砂天麻丸青州白丸子辰砂丸牛
尚论篇
卷上·正编风病诸候上风偏枯候风失音不语候风口候风四肢拘挛不得屈伸候风身体两足不随候风鳅手足不随候偏风候风不仁候风湿痹候风湿候风鳅候风惊候风病诸候下风冷候头面风候风头眩候风癫候风邪候鬼邪候风瘙身体隐轸候
缪序卷一一、卒尸二、痹三、？（痉）四、痿五、厥六、伤寒六经余证七、大头肿痛（附:蛤蟆瘟）蛤蟆瘟八、霍乱九、瘟病十、伤暑十一、疟十二、疸十三、劳（劳极 烦热 劳瘵）劳极烦热劳瘵卷二十四、热十五、吐衄下血
第1部分第2部分
简介序卷一 内科卷二 妇人科卷三 小儿科卷四 外科卷五 通治
石药尔雅
通俗序壶天性果女丹十则（一卷）第一则·养真化气第二则·九转炼形第三则·运用火符第四则·默运胎息第五则·广立功行第六则·志坚行持第七则·调养元神第八则·移神出壳第九则·待度飞升第十则·了道成真女金丹序上